Protein–RNA interactions for Protein: Q52LW3

ARHGAP29, Rho GTPase-activating protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP29Q52LW3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARHGAP29Q52LW3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGAP29Q52LW3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGAP29Q52LW3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGAP29Q52LW3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGAP29Q52LW3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGAP29Q52LW3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGAP29Q52LW3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGAP29Q52LW3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGAP29Q52LW3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGAP29Q52LW3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGAP29Q52LW3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGAP29Q52LW3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGAP29Q52LW3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGAP29Q52LW3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGAP29Q52LW3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGAP29Q52LW3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGAP29Q52LW3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGAP29Q52LW3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGAP29Q52LW3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGAP29Q52LW3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGAP29Q52LW3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGAP29Q52LW3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARHGAP29Q52LW3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARHGAP29Q52LW3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARHGAP29Q52LW3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARHGAP29Q52LW3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARHGAP29Q52LW3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARHGAP29Q52LW3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ARHGAP29Q52LW3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARHGAP29Q52LW3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARHGAP29Q52LW3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ARHGAP29Q52LW3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARHGAP29Q52LW3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARHGAP29Q52LW3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARHGAP29Q52LW3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARHGAP29Q52LW3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARHGAP29Q52LW3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARHGAP29Q52LW3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARHGAP29Q52LW3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARHGAP29Q52LW3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARHGAP29Q52LW3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARHGAP29Q52LW3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARHGAP29Q52LW3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARHGAP29Q52LW3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARHGAP29Q52LW3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARHGAP29Q52LW3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ARHGAP29Q52LW3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARHGAP29Q52LW3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ARHGAP29Q52LW3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ARHGAP29Q52LW3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGAP29Q52LW3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGAP29Q52LW3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGAP29Q52LW3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGAP29Q52LW3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGAP29Q52LW3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGAP29Q52LW3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGAP29Q52LW3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGAP29Q52LW3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGAP29Q52LW3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGAP29Q52LW3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGAP29Q52LW3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGAP29Q52LW3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGAP29Q52LW3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGAP29Q52LW3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGAP29Q52LW3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGAP29Q52LW3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGAP29Q52LW3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGAP29Q52LW3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGAP29Q52LW3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGAP29Q52LW3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGAP29Q52LW3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGAP29Q52LW3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGAP29Q52LW3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGAP29Q52LW3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGAP29Q52LW3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGAP29Q52LW3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGAP29Q52LW3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGAP29Q52LW3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGAP29Q52LW3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGAP29Q52LW3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGAP29Q52LW3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGAP29Q52LW3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGAP29Q52LW3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGAP29Q52LW3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGAP29Q52LW3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGAP29Q52LW3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGAP29Q52LW3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGAP29Q52LW3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGAP29Q52LW3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGAP29Q52LW3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGAP29Q52LW3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGAP29Q52LW3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGAP29Q52LW3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGAP29Q52LW3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGAP29Q52LW3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGAP29Q52LW3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGAP29Q52LW3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGAP29Q52LW3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGAP29Q52LW3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms