Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0N8

SLC9C1, Sodium/hydrogen exchanger 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9C1Q4G0N8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC9C1Q4G0N8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC9C1Q4G0N8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC9C1Q4G0N8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC9C1Q4G0N8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC9C1Q4G0N8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SLC9C1Q4G0N8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SLC9C1Q4G0N8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC9C1Q4G0N8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC9C1Q4G0N8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC9C1Q4G0N8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC9C1Q4G0N8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC9C1Q4G0N8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC9C1Q4G0N8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC9C1Q4G0N8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC9C1Q4G0N8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC9C1Q4G0N8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC9C1Q4G0N8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC9C1Q4G0N8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC9C1Q4G0N8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC9C1Q4G0N8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC9C1Q4G0N8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC9C1Q4G0N8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC9C1Q4G0N8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC9C1Q4G0N8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC9C1Q4G0N8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC9C1Q4G0N8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC9C1Q4G0N8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC9C1Q4G0N8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC9C1Q4G0N8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC9C1Q4G0N8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC9C1Q4G0N8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC9C1Q4G0N8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC9C1Q4G0N8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC9C1Q4G0N8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC9C1Q4G0N8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC9C1Q4G0N8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC9C1Q4G0N8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC9C1Q4G0N8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC9C1Q4G0N8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC9C1Q4G0N8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC9C1Q4G0N8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC9C1Q4G0N8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC9C1Q4G0N8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC9C1Q4G0N8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC9C1Q4G0N8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC9C1Q4G0N8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC9C1Q4G0N8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC9C1Q4G0N8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC9C1Q4G0N8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC9C1Q4G0N8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC9C1Q4G0N8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC9C1Q4G0N8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC9C1Q4G0N8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC9C1Q4G0N8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC9C1Q4G0N8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC9C1Q4G0N8 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC9C1Q4G0N8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC9C1Q4G0N8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC9C1Q4G0N8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC9C1Q4G0N8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC9C1Q4G0N8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC9C1Q4G0N8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC9C1Q4G0N8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC9C1Q4G0N8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC9C1Q4G0N8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC9C1Q4G0N8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC9C1Q4G0N8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC9C1Q4G0N8 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC9C1Q4G0N8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC9C1Q4G0N8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC9C1Q4G0N8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC9C1Q4G0N8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC9C1Q4G0N8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC9C1Q4G0N8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC9C1Q4G0N8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
SLC9C1Q4G0N8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC9C1Q4G0N8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC9C1Q4G0N8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC9C1Q4G0N8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC9C1Q4G0N8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC9C1Q4G0N8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC9C1Q4G0N8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC9C1Q4G0N8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC9C1Q4G0N8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC9C1Q4G0N8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC9C1Q4G0N8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC9C1Q4G0N8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC9C1Q4G0N8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC9C1Q4G0N8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC9C1Q4G0N8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC9C1Q4G0N8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC9C1Q4G0N8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC9C1Q4G0N8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC9C1Q4G0N8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC9C1Q4G0N8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC9C1Q4G0N8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC9C1Q4G0N8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC9C1Q4G0N8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC9C1Q4G0N8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms