Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RNF212Q495C1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RNF212Q495C1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms