Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLPPQ16740 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLPPQ16740 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLPPQ16740 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLPPQ16740 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLPPQ16740 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLPPQ16740 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CLPPQ16740 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CLPPQ16740 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLPPQ16740 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLPPQ16740 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLPPQ16740 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLPPQ16740 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLPPQ16740 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLPPQ16740 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLPPQ16740 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLPPQ16740 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLPPQ16740 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLPPQ16740 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLPPQ16740 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLPPQ16740 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLPPQ16740 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLPPQ16740 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLPPQ16740 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLPPQ16740 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLPPQ16740 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLPPQ16740 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLPPQ16740 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLPPQ16740 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CLPPQ16740 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLPPQ16740 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CLPPQ16740 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLPPQ16740 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLPPQ16740 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLPPQ16740 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CLPPQ16740 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLPPQ16740 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLPPQ16740 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CLPPQ16740 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLPPQ16740 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLPPQ16740 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLPPQ16740 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLPPQ16740 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLPPQ16740 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CLPPQ16740 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CLPPQ16740 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLPPQ16740 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLPPQ16740 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLPPQ16740 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLPPQ16740 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLPPQ16740 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLPPQ16740 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CLPPQ16740 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLPPQ16740 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLPPQ16740 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLPPQ16740 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLPPQ16740 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLPPQ16740 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLPPQ16740 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLPPQ16740 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLPPQ16740 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLPPQ16740 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLPPQ16740 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLPPQ16740 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CLPPQ16740 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLPPQ16740 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLPPQ16740 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLPPQ16740 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CLPPQ16740 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
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