Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SSX1Q16384 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SSX1Q16384 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SSX1Q16384 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SSX1Q16384 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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SSX1Q16384 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SSX1Q16384 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SSX1Q16384 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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SSX1Q16384 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SSX1Q16384 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SSX1Q16384 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SSX1Q16384 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SSX1Q16384 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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