Protein–RNA interactions for Protein: Q15643

TRIP11, Thyroid receptor-interacting protein 11, humanhuman

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Length 1,979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP11Q15643 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIP11Q15643 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIP11Q15643 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIP11Q15643 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIP11Q15643 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIP11Q15643 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIP11Q15643 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIP11Q15643 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIP11Q15643 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIP11Q15643 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIP11Q15643 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIP11Q15643 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIP11Q15643 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIP11Q15643 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIP11Q15643 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIP11Q15643 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIP11Q15643 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIP11Q15643 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIP11Q15643 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIP11Q15643 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIP11Q15643 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIP11Q15643 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIP11Q15643 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIP11Q15643 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIP11Q15643 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIP11Q15643 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIP11Q15643 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIP11Q15643 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIP11Q15643 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIP11Q15643 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIP11Q15643 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIP11Q15643 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIP11Q15643 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIP11Q15643 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIP11Q15643 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIP11Q15643 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIP11Q15643 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIP11Q15643 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIP11Q15643 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIP11Q15643 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIP11Q15643 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIP11Q15643 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIP11Q15643 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIP11Q15643 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIP11Q15643 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIP11Q15643 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIP11Q15643 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIP11Q15643 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIP11Q15643 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIP11Q15643 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIP11Q15643 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIP11Q15643 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIP11Q15643 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIP11Q15643 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIP11Q15643 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIP11Q15643 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIP11Q15643 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIP11Q15643 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIP11Q15643 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIP11Q15643 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIP11Q15643 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIP11Q15643 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIP11Q15643 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIP11Q15643 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIP11Q15643 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIP11Q15643 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIP11Q15643 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIP11Q15643 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIP11Q15643 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIP11Q15643 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIP11Q15643 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIP11Q15643 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIP11Q15643 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIP11Q15643 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIP11Q15643 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIP11Q15643 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIP11Q15643 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIP11Q15643 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIP11Q15643 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIP11Q15643 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIP11Q15643 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIP11Q15643 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIP11Q15643 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIP11Q15643 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIP11Q15643 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIP11Q15643 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIP11Q15643 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIP11Q15643 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIP11Q15643 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIP11Q15643 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIP11Q15643 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIP11Q15643 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIP11Q15643 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIP11Q15643 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIP11Q15643 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIP11Q15643 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIP11Q15643 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIP11Q15643 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIP11Q15643 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIP11Q15643 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
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