Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAM1Q15629 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAM1Q15629 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAM1Q15629 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAM1Q15629 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAM1Q15629 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAM1Q15629 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAM1Q15629 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAM1Q15629 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAM1Q15629 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAM1Q15629 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAM1Q15629 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAM1Q15629 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAM1Q15629 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAM1Q15629 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAM1Q15629 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAM1Q15629 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAM1Q15629 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAM1Q15629 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAM1Q15629 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAM1Q15629 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAM1Q15629 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAM1Q15629 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAM1Q15629 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAM1Q15629 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAM1Q15629 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAM1Q15629 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAM1Q15629 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAM1Q15629 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAM1Q15629 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAM1Q15629 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAM1Q15629 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAM1Q15629 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAM1Q15629 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAM1Q15629 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TRAM1Q15629 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAM1Q15629 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAM1Q15629 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAM1Q15629 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAM1Q15629 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAM1Q15629 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAM1Q15629 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAM1Q15629 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAM1Q15629 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAM1Q15629 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAM1Q15629 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAM1Q15629 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAM1Q15629 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAM1Q15629 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAM1Q15629 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAM1Q15629 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAM1Q15629 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAM1Q15629 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAM1Q15629 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAM1Q15629 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAM1Q15629 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAM1Q15629 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAM1Q15629 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAM1Q15629 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAM1Q15629 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAM1Q15629 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAM1Q15629 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAM1Q15629 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAM1Q15629 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAM1Q15629 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAM1Q15629 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAM1Q15629 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAM1Q15629 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAM1Q15629 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAM1Q15629 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAM1Q15629 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAM1Q15629 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAM1Q15629 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAM1Q15629 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAM1Q15629 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAM1Q15629 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAM1Q15629 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAM1Q15629 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAM1Q15629 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAM1Q15629 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAM1Q15629 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAM1Q15629 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAM1Q15629 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAM1Q15629 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAM1Q15629 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAM1Q15629 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAM1Q15629 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAM1Q15629 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAM1Q15629 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAM1Q15629 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAM1Q15629 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAM1Q15629 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAM1Q15629 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAM1Q15629 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAM1Q15629 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAM1Q15629 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAM1Q15629 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAM1Q15629 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAM1Q15629 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAM1Q15629 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms