Protein–RNA interactions for Protein: Q15526

SURF1, Surfeit locus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF1Q15526 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SURF1Q15526 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SURF1Q15526 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SURF1Q15526 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SURF1Q15526 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SURF1Q15526 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SURF1Q15526 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SURF1Q15526 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SURF1Q15526 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SURF1Q15526 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SURF1Q15526 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SURF1Q15526 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SURF1Q15526 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SURF1Q15526 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SURF1Q15526 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SURF1Q15526 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SURF1Q15526 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SURF1Q15526 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SURF1Q15526 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SURF1Q15526 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SURF1Q15526 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SURF1Q15526 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SURF1Q15526 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SURF1Q15526 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SURF1Q15526 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SURF1Q15526 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SURF1Q15526 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SURF1Q15526 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SURF1Q15526 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SURF1Q15526 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SURF1Q15526 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SURF1Q15526 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
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