Protein–RNA interactions for Protein: Q15406

NR6A1, Nuclear receptor subfamily 6 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR6A1Q15406 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
NR6A1Q15406 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NR6A1Q15406 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NR6A1Q15406 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NR6A1Q15406 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NR6A1Q15406 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NR6A1Q15406 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NR6A1Q15406 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NR6A1Q15406 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NR6A1Q15406 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NR6A1Q15406 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NR6A1Q15406 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NR6A1Q15406 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NR6A1Q15406 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NR6A1Q15406 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NR6A1Q15406 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NR6A1Q15406 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NR6A1Q15406 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NR6A1Q15406 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NR6A1Q15406 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NR6A1Q15406 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NR6A1Q15406 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NR6A1Q15406 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NR6A1Q15406 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NR6A1Q15406 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NR6A1Q15406 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NR6A1Q15406 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NR6A1Q15406 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NR6A1Q15406 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NR6A1Q15406 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NR6A1Q15406 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NR6A1Q15406 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NR6A1Q15406 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NR6A1Q15406 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NR6A1Q15406 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NR6A1Q15406 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NR6A1Q15406 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NR6A1Q15406 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NR6A1Q15406 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NR6A1Q15406 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NR6A1Q15406 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NR6A1Q15406 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NR6A1Q15406 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NR6A1Q15406 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NR6A1Q15406 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NR6A1Q15406 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NR6A1Q15406 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NR6A1Q15406 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NR6A1Q15406 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NR6A1Q15406 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NR6A1Q15406 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NR6A1Q15406 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NR6A1Q15406 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NR6A1Q15406 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NR6A1Q15406 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NR6A1Q15406 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NR6A1Q15406 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NR6A1Q15406 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NR6A1Q15406 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NR6A1Q15406 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NR6A1Q15406 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NR6A1Q15406 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NR6A1Q15406 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NR6A1Q15406 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NR6A1Q15406 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NR6A1Q15406 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NR6A1Q15406 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NR6A1Q15406 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NR6A1Q15406 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NR6A1Q15406 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NR6A1Q15406 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NR6A1Q15406 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NR6A1Q15406 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NR6A1Q15406 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NR6A1Q15406 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
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