Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTF1Q15361 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TTF1Q15361 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TTF1Q15361 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TTF1Q15361 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TTF1Q15361 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TTF1Q15361 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TTF1Q15361 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TTF1Q15361 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTF1Q15361 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTF1Q15361 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTF1Q15361 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTF1Q15361 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTF1Q15361 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTF1Q15361 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTF1Q15361 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTF1Q15361 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTF1Q15361 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTF1Q15361 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TTF1Q15361 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TTF1Q15361 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTF1Q15361 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTF1Q15361 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTF1Q15361 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTF1Q15361 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTF1Q15361 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TTF1Q15361 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTF1Q15361 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTF1Q15361 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTF1Q15361 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTF1Q15361 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTF1Q15361 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTF1Q15361 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TTF1Q15361 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTF1Q15361 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TTF1Q15361 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTF1Q15361 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTF1Q15361 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTF1Q15361 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTF1Q15361 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTF1Q15361 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTF1Q15361 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTF1Q15361 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTF1Q15361 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTF1Q15361 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTF1Q15361 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTF1Q15361 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTF1Q15361 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTF1Q15361 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTF1Q15361 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TTF1Q15361 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTF1Q15361 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTF1Q15361 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTF1Q15361 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTF1Q15361 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TTF1Q15361 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TTF1Q15361 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TTF1Q15361 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
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