Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LAPTM4AQ15012 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LAPTM4AQ15012 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LAPTM4AQ15012 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LAPTM4AQ15012 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LAPTM4AQ15012 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LAPTM4AQ15012 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LAPTM4AQ15012 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LAPTM4AQ15012 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LAPTM4AQ15012 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LAPTM4AQ15012 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LAPTM4AQ15012 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LAPTM4AQ15012 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LAPTM4AQ15012 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LAPTM4AQ15012 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LAPTM4AQ15012 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LAPTM4AQ15012 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LAPTM4AQ15012 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LAPTM4AQ15012 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LAPTM4AQ15012 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
LAPTM4AQ15012 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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