Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE1CQ14123 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE1CQ14123 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE1CQ14123 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE1CQ14123 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE1CQ14123 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE1CQ14123 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE1CQ14123 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE1CQ14123 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE1CQ14123 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE1CQ14123 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE1CQ14123 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE1CQ14123 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE1CQ14123 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE1CQ14123 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE1CQ14123 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE1CQ14123 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE1CQ14123 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE1CQ14123 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE1CQ14123 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE1CQ14123 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE1CQ14123 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE1CQ14123 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE1CQ14123 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE1CQ14123 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE1CQ14123 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE1CQ14123 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE1CQ14123 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE1CQ14123 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE1CQ14123 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE1CQ14123 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE1CQ14123 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE1CQ14123 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE1CQ14123 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE1CQ14123 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE1CQ14123 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE1CQ14123 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE1CQ14123 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE1CQ14123 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE1CQ14123 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE1CQ14123 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE1CQ14123 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE1CQ14123 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE1CQ14123 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE1CQ14123 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE1CQ14123 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE1CQ14123 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE1CQ14123 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE1CQ14123 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE1CQ14123 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE1CQ14123 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE1CQ14123 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE1CQ14123 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE1CQ14123 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE1CQ14123 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PDE1CQ14123 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE1CQ14123 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE1CQ14123 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE1CQ14123 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE1CQ14123 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE1CQ14123 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE1CQ14123 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE1CQ14123 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE1CQ14123 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE1CQ14123 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE1CQ14123 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE1CQ14123 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE1CQ14123 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE1CQ14123 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE1CQ14123 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE1CQ14123 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE1CQ14123 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE1CQ14123 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE1CQ14123 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE1CQ14123 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE1CQ14123 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE1CQ14123 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE1CQ14123 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE1CQ14123 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE1CQ14123 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE1CQ14123 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE1CQ14123 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE1CQ14123 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE1CQ14123 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE1CQ14123 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE1CQ14123 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE1CQ14123 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE1CQ14123 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE1CQ14123 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE1CQ14123 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE1CQ14123 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE1CQ14123 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE1CQ14123 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE1CQ14123 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE1CQ14123 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE1CQ14123 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE1CQ14123 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE1CQ14123 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE1CQ14123 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE1CQ14123 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
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