Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALCAMQ13740 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALCAMQ13740 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALCAMQ13740 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALCAMQ13740 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALCAMQ13740 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALCAMQ13740 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALCAMQ13740 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALCAMQ13740 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALCAMQ13740 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALCAMQ13740 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ALCAMQ13740 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALCAMQ13740 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALCAMQ13740 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALCAMQ13740 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALCAMQ13740 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ALCAMQ13740 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALCAMQ13740 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALCAMQ13740 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALCAMQ13740 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALCAMQ13740 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALCAMQ13740 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALCAMQ13740 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALCAMQ13740 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALCAMQ13740 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALCAMQ13740 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALCAMQ13740 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALCAMQ13740 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALCAMQ13740 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALCAMQ13740 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALCAMQ13740 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALCAMQ13740 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ALCAMQ13740 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ALCAMQ13740 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALCAMQ13740 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALCAMQ13740 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALCAMQ13740 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALCAMQ13740 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALCAMQ13740 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALCAMQ13740 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALCAMQ13740 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALCAMQ13740 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALCAMQ13740 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALCAMQ13740 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALCAMQ13740 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALCAMQ13740 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ALCAMQ13740 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALCAMQ13740 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALCAMQ13740 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALCAMQ13740 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALCAMQ13740 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALCAMQ13740 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ALCAMQ13740 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ALCAMQ13740 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ALCAMQ13740 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ALCAMQ13740 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ALCAMQ13740 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALCAMQ13740 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALCAMQ13740 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ALCAMQ13740 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALCAMQ13740 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALCAMQ13740 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALCAMQ13740 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ALCAMQ13740 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALCAMQ13740 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALCAMQ13740 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALCAMQ13740 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALCAMQ13740 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALCAMQ13740 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALCAMQ13740 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALCAMQ13740 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALCAMQ13740 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALCAMQ13740 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALCAMQ13740 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALCAMQ13740 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALCAMQ13740 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALCAMQ13740 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALCAMQ13740 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALCAMQ13740 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ALCAMQ13740 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALCAMQ13740 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALCAMQ13740 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALCAMQ13740 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALCAMQ13740 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ALCAMQ13740 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALCAMQ13740 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALCAMQ13740 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALCAMQ13740 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALCAMQ13740 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALCAMQ13740 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ALCAMQ13740 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALCAMQ13740 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALCAMQ13740 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALCAMQ13740 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALCAMQ13740 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALCAMQ13740 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALCAMQ13740 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALCAMQ13740 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALCAMQ13740 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALCAMQ13740 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
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