Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

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Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PICALMQ13492 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PICALMQ13492 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PICALMQ13492 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PICALMQ13492 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PICALMQ13492 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PICALMQ13492 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PICALMQ13492 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PICALMQ13492 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PICALMQ13492 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PICALMQ13492 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PICALMQ13492 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PICALMQ13492 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PICALMQ13492 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PICALMQ13492 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PICALMQ13492 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PICALMQ13492 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PICALMQ13492 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PICALMQ13492 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PICALMQ13492 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PICALMQ13492 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PICALMQ13492 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PICALMQ13492 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PICALMQ13492 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PICALMQ13492 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PICALMQ13492 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PICALMQ13492 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PICALMQ13492 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PICALMQ13492 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PICALMQ13492 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PICALMQ13492 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PICALMQ13492 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PICALMQ13492 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PICALMQ13492 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PICALMQ13492 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PICALMQ13492 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PICALMQ13492 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PICALMQ13492 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PICALMQ13492 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PICALMQ13492 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PICALMQ13492 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PICALMQ13492 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PICALMQ13492 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PICALMQ13492 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PICALMQ13492 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PICALMQ13492 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PICALMQ13492 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PICALMQ13492 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PICALMQ13492 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PICALMQ13492 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PICALMQ13492 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PICALMQ13492 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PICALMQ13492 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PICALMQ13492 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PICALMQ13492 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PICALMQ13492 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PICALMQ13492 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PICALMQ13492 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PICALMQ13492 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PICALMQ13492 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PICALMQ13492 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PICALMQ13492 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PICALMQ13492 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PICALMQ13492 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PICALMQ13492 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PICALMQ13492 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PICALMQ13492 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PICALMQ13492 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PICALMQ13492 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PICALMQ13492 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PICALMQ13492 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PICALMQ13492 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PICALMQ13492 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PICALMQ13492 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PICALMQ13492 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PICALMQ13492 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PICALMQ13492 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PICALMQ13492 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PICALMQ13492 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PICALMQ13492 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PICALMQ13492 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PICALMQ13492 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PICALMQ13492 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PICALMQ13492 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PICALMQ13492 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PICALMQ13492 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PICALMQ13492 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PICALMQ13492 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PICALMQ13492 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PICALMQ13492 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PICALMQ13492 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PICALMQ13492 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PICALMQ13492 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PICALMQ13492 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PICALMQ13492 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PICALMQ13492 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PICALMQ13492 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PICALMQ13492 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PICALMQ13492 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PICALMQ13492 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
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