Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLF1Q13351 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLF1Q13351 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLF1Q13351 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KLF1Q13351 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLF1Q13351 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KLF1Q13351 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLF1Q13351 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLF1Q13351 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLF1Q13351 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLF1Q13351 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLF1Q13351 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLF1Q13351 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLF1Q13351 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLF1Q13351 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KLF1Q13351 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLF1Q13351 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLF1Q13351 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLF1Q13351 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLF1Q13351 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLF1Q13351 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLF1Q13351 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLF1Q13351 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLF1Q13351 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLF1Q13351 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLF1Q13351 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLF1Q13351 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLF1Q13351 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLF1Q13351 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLF1Q13351 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLF1Q13351 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLF1Q13351 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLF1Q13351 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLF1Q13351 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLF1Q13351 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLF1Q13351 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLF1Q13351 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLF1Q13351 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLF1Q13351 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLF1Q13351 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLF1Q13351 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLF1Q13351 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLF1Q13351 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLF1Q13351 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLF1Q13351 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLF1Q13351 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLF1Q13351 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLF1Q13351 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLF1Q13351 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLF1Q13351 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLF1Q13351 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLF1Q13351 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLF1Q13351 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLF1Q13351 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KLF1Q13351 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KLF1Q13351 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KLF1Q13351 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KLF1Q13351 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLF1Q13351 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLF1Q13351 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLF1Q13351 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLF1Q13351 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLF1Q13351 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLF1Q13351 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLF1Q13351 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLF1Q13351 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLF1Q13351 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLF1Q13351 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLF1Q13351 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLF1Q13351 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLF1Q13351 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLF1Q13351 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLF1Q13351 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLF1Q13351 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLF1Q13351 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLF1Q13351 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLF1Q13351 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KLF1Q13351 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KLF1Q13351 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLF1Q13351 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLF1Q13351 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLF1Q13351 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLF1Q13351 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLF1Q13351 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLF1Q13351 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLF1Q13351 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLF1Q13351 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLF1Q13351 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLF1Q13351 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLF1Q13351 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLF1Q13351 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLF1Q13351 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLF1Q13351 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLF1Q13351 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLF1Q13351 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLF1Q13351 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KLF1Q13351 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLF1Q13351 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLF1Q13351 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLF1Q13351 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
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