Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKP2Q13309 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
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