Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NME3Q13232 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NME3Q13232 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NME3Q13232 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NME3Q13232 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NME3Q13232 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NME3Q13232 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NME3Q13232 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NME3Q13232 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NME3Q13232 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NME3Q13232 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NME3Q13232 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NME3Q13232 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NME3Q13232 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NME3Q13232 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NME3Q13232 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NME3Q13232 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NME3Q13232 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NME3Q13232 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NME3Q13232 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NME3Q13232 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NME3Q13232 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NME3Q13232 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NME3Q13232 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NME3Q13232 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NME3Q13232 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NME3Q13232 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NME3Q13232 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NME3Q13232 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NME3Q13232 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NME3Q13232 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NME3Q13232 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NME3Q13232 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NME3Q13232 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NME3Q13232 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NME3Q13232 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NME3Q13232 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NME3Q13232 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NME3Q13232 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NME3Q13232 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NME3Q13232 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NME3Q13232 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NME3Q13232 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NME3Q13232 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NME3Q13232 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NME3Q13232 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NME3Q13232 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NME3Q13232 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NME3Q13232 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NME3Q13232 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NME3Q13232 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NME3Q13232 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NME3Q13232 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NME3Q13232 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NME3Q13232 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NME3Q13232 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NME3Q13232 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NME3Q13232 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NME3Q13232 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NME3Q13232 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NME3Q13232 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NME3Q13232 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NME3Q13232 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NME3Q13232 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NME3Q13232 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NME3Q13232 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NME3Q13232 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NME3Q13232 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NME3Q13232 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NME3Q13232 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NME3Q13232 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NME3Q13232 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NME3Q13232 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NME3Q13232 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NME3Q13232 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NME3Q13232 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NME3Q13232 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NME3Q13232 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NME3Q13232 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NME3Q13232 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NME3Q13232 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NME3Q13232 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NME3Q13232 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NME3Q13232 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NME3Q13232 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NME3Q13232 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NME3Q13232 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NME3Q13232 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NME3Q13232 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NME3Q13232 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NME3Q13232 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NME3Q13232 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NME3Q13232 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NME3Q13232 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NME3Q13232 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NME3Q13232 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NME3Q13232 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NME3Q13232 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NME3Q13232 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NME3Q13232 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
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