Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RLFQ13129 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RLFQ13129 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RLFQ13129 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RLFQ13129 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RLFQ13129 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RLFQ13129 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RLFQ13129 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RLFQ13129 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RLFQ13129 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RLFQ13129 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RLFQ13129 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RLFQ13129 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RLFQ13129 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RLFQ13129 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RLFQ13129 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RLFQ13129 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RLFQ13129 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RLFQ13129 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RLFQ13129 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RLFQ13129 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RLFQ13129 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RLFQ13129 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RLFQ13129 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RLFQ13129 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RLFQ13129 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RLFQ13129 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RLFQ13129 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RLFQ13129 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RLFQ13129 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RLFQ13129 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RLFQ13129 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RLFQ13129 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RLFQ13129 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RLFQ13129 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RLFQ13129 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RLFQ13129 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RLFQ13129 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RLFQ13129 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RLFQ13129 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RLFQ13129 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RLFQ13129 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RLFQ13129 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RLFQ13129 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RLFQ13129 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RLFQ13129 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RLFQ13129 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RLFQ13129 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RLFQ13129 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RLFQ13129 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RLFQ13129 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RLFQ13129 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RLFQ13129 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RLFQ13129 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
RLFQ13129 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
RLFQ13129 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
RLFQ13129 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
RLFQ13129 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RLFQ13129 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RLFQ13129 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RLFQ13129 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RLFQ13129 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RLFQ13129 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RLFQ13129 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RLFQ13129 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RLFQ13129 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RLFQ13129 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RLFQ13129 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RLFQ13129 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RLFQ13129 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RLFQ13129 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RLFQ13129 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RLFQ13129 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RLFQ13129 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RLFQ13129 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RLFQ13129 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RLFQ13129 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RLFQ13129 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RLFQ13129 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RLFQ13129 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RLFQ13129 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RLFQ13129 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RLFQ13129 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RLFQ13129 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RLFQ13129 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RLFQ13129 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RLFQ13129 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RLFQ13129 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RLFQ13129 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RLFQ13129 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RLFQ13129 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RLFQ13129 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RLFQ13129 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RLFQ13129 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RLFQ13129 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RLFQ13129 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RLFQ13129 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RLFQ13129 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RLFQ13129 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RLFQ13129 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms