Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPS1Q13098 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPS1Q13098 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPS1Q13098 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPS1Q13098 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPS1Q13098 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPS1Q13098 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPS1Q13098 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPS1Q13098 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPS1Q13098 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPS1Q13098 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPS1Q13098 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPS1Q13098 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPS1Q13098 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPS1Q13098 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPS1Q13098 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPS1Q13098 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPS1Q13098 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPS1Q13098 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPS1Q13098 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPS1Q13098 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPS1Q13098 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPS1Q13098 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPS1Q13098 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GPS1Q13098 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPS1Q13098 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPS1Q13098 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPS1Q13098 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPS1Q13098 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPS1Q13098 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPS1Q13098 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPS1Q13098 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GPS1Q13098 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GPS1Q13098 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
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