Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAF1Q13077 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAF1Q13077 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAF1Q13077 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAF1Q13077 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAF1Q13077 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAF1Q13077 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAF1Q13077 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAF1Q13077 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAF1Q13077 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAF1Q13077 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAF1Q13077 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAF1Q13077 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAF1Q13077 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAF1Q13077 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAF1Q13077 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAF1Q13077 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAF1Q13077 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAF1Q13077 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAF1Q13077 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAF1Q13077 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAF1Q13077 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAF1Q13077 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAF1Q13077 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAF1Q13077 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAF1Q13077 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAF1Q13077 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAF1Q13077 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAF1Q13077 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAF1Q13077 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAF1Q13077 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAF1Q13077 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAF1Q13077 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAF1Q13077 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAF1Q13077 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAF1Q13077 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAF1Q13077 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAF1Q13077 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAF1Q13077 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAF1Q13077 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAF1Q13077 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAF1Q13077 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAF1Q13077 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAF1Q13077 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAF1Q13077 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAF1Q13077 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAF1Q13077 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAF1Q13077 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAF1Q13077 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAF1Q13077 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TRAF1Q13077 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TRAF1Q13077 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TRAF1Q13077 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TRAF1Q13077 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAF1Q13077 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAF1Q13077 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAF1Q13077 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAF1Q13077 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAF1Q13077 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAF1Q13077 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAF1Q13077 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAF1Q13077 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAF1Q13077 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAF1Q13077 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAF1Q13077 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAF1Q13077 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAF1Q13077 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAF1Q13077 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAF1Q13077 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAF1Q13077 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAF1Q13077 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAF1Q13077 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAF1Q13077 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAF1Q13077 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAF1Q13077 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAF1Q13077 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAF1Q13077 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAF1Q13077 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAF1Q13077 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAF1Q13077 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAF1Q13077 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAF1Q13077 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAF1Q13077 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAF1Q13077 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAF1Q13077 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAF1Q13077 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAF1Q13077 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAF1Q13077 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAF1Q13077 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAF1Q13077 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAF1Q13077 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAF1Q13077 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAF1Q13077 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAF1Q13077 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAF1Q13077 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAF1Q13077 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAF1Q13077 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAF1Q13077 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAF1Q13077 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAF1Q13077 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
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