Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KCNMA1Q12791 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNMA1Q12791 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
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