Protein–RNA interactions for Protein: Q12347

HRT3, F-box protein HRT3, yeastyeast

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRT3Q12347 DSS4YPR017C 432 nt4.33□□□□□ -1.72
HRT3Q12347 YPR059CYPR059C 387 nt4.33□□□□□ -1.72
HRT3Q12347 RPG1YBR079C 2895 nt4.33□□□□□ -1.72
HRT3Q12347 UPC2YDR213W 2742 nt4.33□□□□□ -1.72
HRT3Q12347 CTF18YMR078C 2226 nt4.33□□□□□ -1.72
HRT3Q12347 TRM44YPL030W 1704 nt4.32□□□□□ -1.72
HRT3Q12347 RSC58YLR033W 1509 nt4.32□□□□□ -1.72
HRT3Q12347 KRE29YER038C 1395 nt4.32□□□□□ -1.72
HRT3Q12347 NTA1YJR062C 1374 nt4.32□□□□□ -1.72
HRT3Q12347 PTC1YDL006W 846 nt4.32□□□□□ -1.72
HRT3Q12347 YGL152CYGL152C 678 nt4.32□□□□□ -1.72
HRT3Q12347 VTA1YLR181C 993 nt4.32□□□□□ -1.72
HRT3Q12347 ESF1YDR365C 1887 nt4.32□□□□□ -1.72
HRT3Q12347 GCR2YNL199C 1605 nt4.32□□□□□ -1.72
HRT3Q12347 VAC7YNL054W 3498 nt4.31□□□□□ -1.72
HRT3Q12347 SPC105YGL093W 2754 nt4.31□□□□□ -1.72
HRT3Q12347 MMR1YLR190W 1476 nt4.31□□□□□ -1.72
HRT3Q12347 PMC1YGL006W 3522 nt4.31□□□□□ -1.72
HRT3Q12347 RAM1YDL090C 1296 nt4.31□□□□□ -1.72
HRT3Q12347 YKE4YIL023C 1041 nt4.31□□□□□ -1.72
HRT3Q12347 ADD37YMR184W 597 nt4.31□□□□□ -1.72
HRT3Q12347 RET3YPL010W 570 nt4.31□□□□□ -1.72
HRT3Q12347 YDC1YPL087W 954 nt4.31□□□□□ -1.72
HRT3Q12347 PRP28YDR243C 1767 nt4.31□□□□□ -1.72
HRT3Q12347 FAR10YLR238W 1437 nt4.3□□□□□ -1.72
HRT3Q12347 KRS1YDR037W 1776 nt4.3□□□□□ -1.72
HRT3Q12347 UPS3YDR185C 540 nt4.3□□□□□ -1.72
HRT3Q12347 IRC22YEL001C 678 nt4.3□□□□□ -1.72
HRT3Q12347 AAD6YFL056C 639 nt4.3□□□□□ -1.72
HRT3Q12347 RDN5-1RDN5-1 121 nt4.3□□□□□ -1.72
HRT3Q12347 YLL017WYLL017W 312 nt4.3□□□□□ -1.72
HRT3Q12347 RDN5-6RDN5-6 121 nt4.3□□□□□ -1.72
HRT3Q12347 PPA2YMR267W 933 nt4.3□□□□□ -1.72
HRT3Q12347 MPH2YDL247W 1830 nt4.3□□□□□ -1.72
HRT3Q12347 MCM2YBL023C 2607 nt4.29□□□□□ -1.72
HRT3Q12347 ATG32YIL146C 1590 nt4.29□□□□□ -1.72
HRT3Q12347 YHR193C-AYHR193C-A 375 nt4.29□□□□□ -1.72
HRT3Q12347 TOM7YNL070W 183 nt4.29□□□□□ -1.72
HRT3Q12347 DCS2YOR173W 1062 nt4.29□□□□□ -1.72
HRT3Q12347 VPS69YPR087W 321 nt4.29□□□□□ -1.72
HRT3Q12347 SKG6YHR149C 2205 nt4.29□□□□□ -1.72
HRT3Q12347 LAS1YKR063C 1509 nt4.28□□□□□ -1.72
HRT3Q12347 ATG1YGL180W 2694 nt4.28□□□□□ -1.72
HRT3Q12347 snR7-LsnR7-L 214 nt4.28□□□□□ -1.72
HRT3Q12347 PCL9YDL179W 915 nt4.28□□□□□ -1.72
HRT3Q12347 THI13YDL244W 1023 nt4.28□□□□□ -1.72
HRT3Q12347 CAF16YFL028C 870 nt4.28□□□□□ -1.72
HRT3Q12347 SUP56tL(CAA)A 82 nt4.28□□□□□ -1.72
HRT3Q12347 SUP53tL(CAA)C 82 nt4.28□□□□□ -1.72
HRT3Q12347 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt4.28□□□□□ -1.72
HRT3Q12347 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt4.28□□□□□ -1.72
HRT3Q12347 SUP54tL(CAA)G2 82 nt4.28□□□□□ -1.72
HRT3Q12347 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt4.28□□□□□ -1.72
HRT3Q12347 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt4.28□□□□□ -1.72
HRT3Q12347 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt4.28□□□□□ -1.72
HRT3Q12347 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt4.28□□□□□ -1.72
HRT3Q12347 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt4.28□□□□□ -1.72
HRT3Q12347 tQ(UUG)CtQ(UUG)C 72 nt4.28□□□□□ -1.72
HRT3Q12347 tQ(UUG)D1tQ(UUG)D1 72 nt4.28□□□□□ -1.72
HRT3Q12347 tQ(UUG)D2tQ(UUG)D2 72 nt4.28□□□□□ -1.72
HRT3Q12347 tQ(UUG)D3tQ(UUG)D3 72 nt4.28□□□□□ -1.72
HRT3Q12347 tQ(UUG)E1tQ(UUG)E1 72 nt4.28□□□□□ -1.72
HRT3Q12347 tQ(UUG)HtQ(UUG)H 72 nt4.28□□□□□ -1.72
HRT3Q12347 tQ(UUG)LtQ(UUG)L 72 nt4.28□□□□□ -1.72
HRT3Q12347 THI11YJR156C 1023 nt4.28□□□□□ -1.72
HRT3Q12347 RAD27YKL113C 1149 nt4.28□□□□□ -1.72
HRT3Q12347 HEK2YBL032W 1146 nt4.28□□□□□ -1.72
HRT3Q12347 POP3YNL282W 588 nt4.28□□□□□ -1.72
HRT3Q12347 YOL035CYOL035C 303 nt4.28□□□□□ -1.72
HRT3Q12347 HFA1YMR207C 6372 nt4.28□□□□□ -1.72
HRT3Q12347 SEN1YLR430W 6696 nt4.27□□□□□ -1.73
HRT3Q12347 EXO70YJL085W 1872 nt4.27□□□□□ -1.73
HRT3Q12347 VPS73YGL104C 1461 nt4.27□□□□□ -1.73
HRT3Q12347 MED2YDL005C 1296 nt4.27□□□□□ -1.73
HRT3Q12347 TDA5YLR426W 981 nt4.27□□□□□ -1.73
HRT3Q12347 PBN1YCL052C 1251 nt4.27□□□□□ -1.73
HRT3Q12347 YPK9YOR291W 4419 nt4.26□□□□□ -1.73
HRT3Q12347 SAP155YFR040W 3009 nt4.26□□□□□ -1.73
HRT3Q12347 RIM21YNL294C 1602 nt4.26□□□□□ -1.73
HRT3Q12347 GDE1YPL110C 3672 nt4.26□□□□□ -1.73
HRT3Q12347 HSP30YCR021C 999 nt4.26□□□□□ -1.73
HRT3Q12347 YDL094CYDL094C 510 nt4.26□□□□□ -1.73
HRT3Q12347 CPR1YDR155C 489 nt4.26□□□□□ -1.73
HRT3Q12347 YJR096WYJR096W 849 nt4.26□□□□□ -1.73
HRT3Q12347 YPL014WYPL014W 1146 nt4.26□□□□□ -1.73
HRT3Q12347 TRF5YNL299W 1929 nt4.26□□□□□ -1.73
HRT3Q12347 STE12YHR084W 2067 nt4.26□□□□□ -1.73
HRT3Q12347 MCM4YPR019W 2802 nt4.26□□□□□ -1.73
HRT3Q12347 SIS2YKR072C 1689 nt4.26□□□□□ -1.73
HRT3Q12347 BUD8YLR353W 1812 nt4.25□□□□□ -1.73
HRT3Q12347 PCL8YPL219W 1479 nt4.25□□□□□ -1.73
HRT3Q12347 CWC2YDL209C 1020 nt4.25□□□□□ -1.73
HRT3Q12347 ECM1YAL059W 639 nt4.25□□□□□ -1.73
HRT3Q12347 PER33YLR064W 822 nt4.25□□□□□ -1.73
HRT3Q12347 YML116W-AYML116W-A 303 nt4.25□□□□□ -1.73
HRT3Q12347 RPC19YNL113W 429 nt4.25□□□□□ -1.73
HRT3Q12347 CBP3YPL215W 1008 nt4.25□□□□□ -1.73
HRT3Q12347 AIM21YIR003W 2040 nt4.24□□□□□ -1.73
HRT3Q12347 EMP47YFL048C 1338 nt4.24□□□□□ -1.73
HRT3Q12347 YCR085WYCR085W 354 nt4.24□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12 ms