Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NIPAL4Q0D2K0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NIPAL4Q0D2K0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NIPAL4Q0D2K0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NIPAL4Q0D2K0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NIPAL4Q0D2K0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NIPAL4Q0D2K0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NIPAL4Q0D2K0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NIPAL4Q0D2K0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NIPAL4Q0D2K0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NIPAL4Q0D2K0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NIPAL4Q0D2K0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NIPAL4Q0D2K0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NIPAL4Q0D2K0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NIPAL4Q0D2K0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NIPAL4Q0D2K0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NIPAL4Q0D2K0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIPAL4Q0D2K0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIPAL4Q0D2K0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIPAL4Q0D2K0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIPAL4Q0D2K0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIPAL4Q0D2K0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIPAL4Q0D2K0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIPAL4Q0D2K0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIPAL4Q0D2K0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIPAL4Q0D2K0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NIPAL4Q0D2K0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NIPAL4Q0D2K0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NIPAL4Q0D2K0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NIPAL4Q0D2K0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NIPAL4Q0D2K0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NIPAL4Q0D2K0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NIPAL4Q0D2K0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NIPAL4Q0D2K0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NIPAL4Q0D2K0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NIPAL4Q0D2K0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NIPAL4Q0D2K0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NIPAL4Q0D2K0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NIPAL4Q0D2K0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NIPAL4Q0D2K0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NIPAL4Q0D2K0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NIPAL4Q0D2K0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NIPAL4Q0D2K0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NIPAL4Q0D2K0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NIPAL4Q0D2K0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NIPAL4Q0D2K0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIPAL4Q0D2K0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIPAL4Q0D2K0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NIPAL4Q0D2K0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIPAL4Q0D2K0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NIPAL4Q0D2K0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIPAL4Q0D2K0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIPAL4Q0D2K0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIPAL4Q0D2K0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIPAL4Q0D2K0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIPAL4Q0D2K0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIPAL4Q0D2K0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NIPAL4Q0D2K0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NIPAL4Q0D2K0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NIPAL4Q0D2K0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NIPAL4Q0D2K0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NIPAL4Q0D2K0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NIPAL4Q0D2K0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NIPAL4Q0D2K0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NIPAL4Q0D2K0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NIPAL4Q0D2K0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NIPAL4Q0D2K0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NIPAL4Q0D2K0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NIPAL4Q0D2K0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIPAL4Q0D2K0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIPAL4Q0D2K0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIPAL4Q0D2K0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIPAL4Q0D2K0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIPAL4Q0D2K0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIPAL4Q0D2K0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIPAL4Q0D2K0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIPAL4Q0D2K0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIPAL4Q0D2K0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIPAL4Q0D2K0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIPAL4Q0D2K0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
NIPAL4Q0D2K0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NIPAL4Q0D2K0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NIPAL4Q0D2K0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NIPAL4Q0D2K0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NIPAL4Q0D2K0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NIPAL4Q0D2K0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NIPAL4Q0D2K0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NIPAL4Q0D2K0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NIPAL4Q0D2K0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NIPAL4Q0D2K0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NIPAL4Q0D2K0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NIPAL4Q0D2K0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NIPAL4Q0D2K0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NIPAL4Q0D2K0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NIPAL4Q0D2K0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NIPAL4Q0D2K0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NIPAL4Q0D2K0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NIPAL4Q0D2K0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NIPAL4Q0D2K0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NIPAL4Q0D2K0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms