Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFFO1Q0D2I5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
IFFO1Q0D2I5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
IFFO1Q0D2I5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFFO1Q0D2I5 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFFO1Q0D2I5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFFO1Q0D2I5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFFO1Q0D2I5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFFO1Q0D2I5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFFO1Q0D2I5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFFO1Q0D2I5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFFO1Q0D2I5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFFO1Q0D2I5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFFO1Q0D2I5 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFFO1Q0D2I5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFFO1Q0D2I5 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFFO1Q0D2I5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFFO1Q0D2I5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFFO1Q0D2I5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFFO1Q0D2I5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFFO1Q0D2I5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFFO1Q0D2I5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
IFFO1Q0D2I5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFFO1Q0D2I5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFFO1Q0D2I5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFFO1Q0D2I5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFFO1Q0D2I5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFFO1Q0D2I5 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFFO1Q0D2I5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFFO1Q0D2I5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFFO1Q0D2I5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IFFO1Q0D2I5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IFFO1Q0D2I5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IFFO1Q0D2I5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IFFO1Q0D2I5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IFFO1Q0D2I5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFFO1Q0D2I5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms