Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SSRP1Q08945 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SSRP1Q08945 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SSRP1Q08945 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SSRP1Q08945 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SSRP1Q08945 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SSRP1Q08945 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SSRP1Q08945 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SSRP1Q08945 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SSRP1Q08945 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SSRP1Q08945 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SSRP1Q08945 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SSRP1Q08945 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SSRP1Q08945 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SSRP1Q08945 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SSRP1Q08945 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SSRP1Q08945 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SSRP1Q08945 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SSRP1Q08945 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SSRP1Q08945 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SSRP1Q08945 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SSRP1Q08945 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SSRP1Q08945 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SSRP1Q08945 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SSRP1Q08945 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SSRP1Q08945 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms