Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE4CQ08493 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE4CQ08493 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE4CQ08493 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE4CQ08493 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE4CQ08493 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE4CQ08493 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE4CQ08493 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE4CQ08493 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE4CQ08493 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE4CQ08493 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE4CQ08493 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE4CQ08493 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE4CQ08493 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE4CQ08493 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE4CQ08493 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE4CQ08493 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE4CQ08493 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE4CQ08493 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE4CQ08493 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE4CQ08493 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE4CQ08493 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE4CQ08493 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE4CQ08493 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE4CQ08493 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE4CQ08493 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE4CQ08493 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE4CQ08493 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE4CQ08493 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE4CQ08493 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE4CQ08493 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE4CQ08493 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE4CQ08493 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE4CQ08493 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE4CQ08493 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE4CQ08493 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE4CQ08493 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE4CQ08493 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE4CQ08493 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE4CQ08493 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE4CQ08493 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE4CQ08493 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms