Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DDR1Q08345 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DDR1Q08345 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DDR1Q08345 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DDR1Q08345 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DDR1Q08345 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DDR1Q08345 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DDR1Q08345 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DDR1Q08345 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DDR1Q08345 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DDR1Q08345 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DDR1Q08345 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DDR1Q08345 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DDR1Q08345 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DDR1Q08345 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DDR1Q08345 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DDR1Q08345 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DDR1Q08345 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DDR1Q08345 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
DDR1Q08345 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
DDR1Q08345 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
DDR1Q08345 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
DDR1Q08345 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
DDR1Q08345 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DDR1Q08345 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DDR1Q08345 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DDR1Q08345 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DDR1Q08345 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
DDR1Q08345 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
DDR1Q08345 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DDR1Q08345 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DDR1Q08345 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DDR1Q08345 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
DDR1Q08345 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DDR1Q08345 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DDR1Q08345 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DDR1Q08345 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DDR1Q08345 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DDR1Q08345 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DDR1Q08345 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DDR1Q08345 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DDR1Q08345 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DDR1Q08345 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DDR1Q08345 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DDR1Q08345 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DDR1Q08345 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DDR1Q08345 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DDR1Q08345 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
DDR1Q08345 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DDR1Q08345 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDR1Q08345 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDR1Q08345 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDR1Q08345 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDR1Q08345 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDR1Q08345 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDR1Q08345 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
DDR1Q08345 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDR1Q08345 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDR1Q08345 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDR1Q08345 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDR1Q08345 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDR1Q08345 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDR1Q08345 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDR1Q08345 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDR1Q08345 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DDR1Q08345 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DDR1Q08345 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DDR1Q08345 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DDR1Q08345 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
DDR1Q08345 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DDR1Q08345 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DDR1Q08345 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
DDR1Q08345 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DDR1Q08345 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DDR1Q08345 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DDR1Q08345 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DDR1Q08345 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DDR1Q08345 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DDR1Q08345 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DDR1Q08345 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DDR1Q08345 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DDR1Q08345 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DDR1Q08345 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DDR1Q08345 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DDR1Q08345 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DDR1Q08345 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DDR1Q08345 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
DDR1Q08345 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDR1Q08345 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDR1Q08345 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDR1Q08345 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDR1Q08345 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
DDR1Q08345 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDR1Q08345 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDR1Q08345 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDR1Q08345 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
DDR1Q08345 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDR1Q08345 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDR1Q08345 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDR1Q08345 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms