Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PSME1Q06323 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PSME1Q06323 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PSME1Q06323 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PSME1Q06323 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PSME1Q06323 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PSME1Q06323 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PSME1Q06323 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PSME1Q06323 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PSME1Q06323 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PSME1Q06323 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PSME1Q06323 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PSME1Q06323 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
PSME1Q06323 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PSME1Q06323 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PSME1Q06323 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PSME1Q06323 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PSME1Q06323 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PSME1Q06323 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
PSME1Q06323 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PSME1Q06323 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PSME1Q06323 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PSME1Q06323 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PSME1Q06323 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PSME1Q06323 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PSME1Q06323 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PSME1Q06323 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PSME1Q06323 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
PSME1Q06323 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
PSME1Q06323 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PSME1Q06323 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PSME1Q06323 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PSME1Q06323 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PSME1Q06323 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
PSME1Q06323 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PSME1Q06323 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PSME1Q06323 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PSME1Q06323 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PSME1Q06323 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PSME1Q06323 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PSME1Q06323 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PSME1Q06323 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PSME1Q06323 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PSME1Q06323 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
PSME1Q06323 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PSME1Q06323 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PSME1Q06323 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
PSME1Q06323 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
PSME1Q06323 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PSME1Q06323 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PSME1Q06323 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PSME1Q06323 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PSME1Q06323 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PSME1Q06323 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PSME1Q06323 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PSME1Q06323 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PSME1Q06323 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
PSME1Q06323 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PSME1Q06323 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PSME1Q06323 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PSME1Q06323 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PSME1Q06323 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PSME1Q06323 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PSME1Q06323 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
PSME1Q06323 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PSME1Q06323 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PSME1Q06323 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PSME1Q06323 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PSME1Q06323 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PSME1Q06323 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PSME1Q06323 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PSME1Q06323 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PSME1Q06323 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PSME1Q06323 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PSME1Q06323 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PSME1Q06323 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PSME1Q06323 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
PSME1Q06323 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
PSME1Q06323 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PSME1Q06323 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PSME1Q06323 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PSME1Q06323 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
PSME1Q06323 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PSME1Q06323 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PSME1Q06323 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PSME1Q06323 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
PSME1Q06323 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PSME1Q06323 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PSME1Q06323 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PSME1Q06323 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PSME1Q06323 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PSME1Q06323 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PSME1Q06323 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PSME1Q06323 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PSME1Q06323 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PSME1Q06323 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PSME1Q06323 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PSME1Q06323 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PSME1Q06323 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PSME1Q06323 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms