Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIN1Q05586 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIN1Q05586 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIN1Q05586 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIN1Q05586 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIN1Q05586 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIN1Q05586 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIN1Q05586 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIN1Q05586 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIN1Q05586 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIN1Q05586 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIN1Q05586 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIN1Q05586 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIN1Q05586 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIN1Q05586 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIN1Q05586 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN1Q05586 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN1Q05586 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN1Q05586 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN1Q05586 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN1Q05586 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN1Q05586 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN1Q05586 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN1Q05586 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN1Q05586 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIN1Q05586 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIN1Q05586 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIN1Q05586 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIN1Q05586 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIN1Q05586 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIN1Q05586 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIN1Q05586 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIN1Q05586 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIN1Q05586 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIN1Q05586 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIN1Q05586 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIN1Q05586 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIN1Q05586 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIN1Q05586 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIN1Q05586 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIN1Q05586 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIN1Q05586 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIN1Q05586 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIN1Q05586 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIN1Q05586 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIN1Q05586 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIN1Q05586 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIN1Q05586 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIN1Q05586 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIN1Q05586 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIN1Q05586 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIN1Q05586 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIN1Q05586 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIN1Q05586 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIN1Q05586 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIN1Q05586 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIN1Q05586 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIN1Q05586 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIN1Q05586 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIN1Q05586 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIN1Q05586 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIN1Q05586 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIN1Q05586 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIN1Q05586 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIN1Q05586 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIN1Q05586 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIN1Q05586 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIN1Q05586 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIN1Q05586 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN1Q05586 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN1Q05586 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN1Q05586 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN1Q05586 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN1Q05586 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN1Q05586 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN1Q05586 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN1Q05586 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN1Q05586 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN1Q05586 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN1Q05586 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN1Q05586 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN1Q05586 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN1Q05586 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN1Q05586 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN1Q05586 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN1Q05586 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN1Q05586 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN1Q05586 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN1Q05586 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN1Q05586 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN1Q05586 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN1Q05586 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN1Q05586 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN1Q05586 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN1Q05586 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
GRIN1Q05586 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIN1Q05586 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIN1Q05586 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIN1Q05586 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIN1Q05586 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms