Protein–RNA interactions for Protein: Q04671

OCA2, P protein, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OCA2Q04671 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
OCA2Q04671 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
OCA2Q04671 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
OCA2Q04671 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OCA2Q04671 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OCA2Q04671 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OCA2Q04671 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OCA2Q04671 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OCA2Q04671 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OCA2Q04671 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
OCA2Q04671 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OCA2Q04671 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OCA2Q04671 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OCA2Q04671 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OCA2Q04671 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OCA2Q04671 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OCA2Q04671 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OCA2Q04671 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OCA2Q04671 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
OCA2Q04671 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OCA2Q04671 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
OCA2Q04671 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms