Protein–RNA interactions for Protein: Q00653

NFKB2, Nuclear factor NF-kappa-B p100 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB2Q00653 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKB2Q00653 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKB2Q00653 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKB2Q00653 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKB2Q00653 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKB2Q00653 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKB2Q00653 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKB2Q00653 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKB2Q00653 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKB2Q00653 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKB2Q00653 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKB2Q00653 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKB2Q00653 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKB2Q00653 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKB2Q00653 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFKB2Q00653 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFKB2Q00653 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFKB2Q00653 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFKB2Q00653 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NFKB2Q00653 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NFKB2Q00653 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NFKB2Q00653 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NFKB2Q00653 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKB2Q00653 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKB2Q00653 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKB2Q00653 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKB2Q00653 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKB2Q00653 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKB2Q00653 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKB2Q00653 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKB2Q00653 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKB2Q00653 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKB2Q00653 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKB2Q00653 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKB2Q00653 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKB2Q00653 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKB2Q00653 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFKB2Q00653 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFKB2Q00653 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFKB2Q00653 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFKB2Q00653 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFKB2Q00653 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFKB2Q00653 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFKB2Q00653 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFKB2Q00653 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NFKB2Q00653 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFKB2Q00653 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFKB2Q00653 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFKB2Q00653 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFKB2Q00653 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFKB2Q00653 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFKB2Q00653 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFKB2Q00653 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NFKB2Q00653 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFKB2Q00653 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFKB2Q00653 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFKB2Q00653 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFKB2Q00653 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFKB2Q00653 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFKB2Q00653 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFKB2Q00653 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFKB2Q00653 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFKB2Q00653 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFKB2Q00653 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFKB2Q00653 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFKB2Q00653 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFKB2Q00653 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFKB2Q00653 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NFKB2Q00653 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFKB2Q00653 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFKB2Q00653 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NFKB2Q00653 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFKB2Q00653 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFKB2Q00653 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFKB2Q00653 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFKB2Q00653 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFKB2Q00653 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFKB2Q00653 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFKB2Q00653 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFKB2Q00653 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFKB2Q00653 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NFKB2Q00653 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFKB2Q00653 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFKB2Q00653 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFKB2Q00653 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFKB2Q00653 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFKB2Q00653 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFKB2Q00653 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFKB2Q00653 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFKB2Q00653 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFKB2Q00653 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKB2Q00653 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms