Protein–RNA interactions for Protein: P98161

PKD1, Polycystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 4,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1P98161 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKD1P98161 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKD1P98161 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKD1P98161 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKD1P98161 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKD1P98161 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKD1P98161 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PKD1P98161 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PKD1P98161 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PKD1P98161 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PKD1P98161 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKD1P98161 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKD1P98161 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKD1P98161 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKD1P98161 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKD1P98161 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKD1P98161 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKD1P98161 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PKD1P98161 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PKD1P98161 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKD1P98161 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PKD1P98161 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PKD1P98161 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PKD1P98161 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PKD1P98161 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PKD1P98161 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PKD1P98161 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PKD1P98161 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PKD1P98161 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PKD1P98161 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PKD1P98161 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PKD1P98161 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PKD1P98161 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PKD1P98161 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKD1P98161 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKD1P98161 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKD1P98161 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKD1P98161 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKD1P98161 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKD1P98161 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PKD1P98161 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKD1P98161 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKD1P98161 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKD1P98161 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKD1P98161 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKD1P98161 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PKD1P98161 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKD1P98161 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKD1P98161 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKD1P98161 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKD1P98161 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKD1P98161 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKD1P98161 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKD1P98161 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKD1P98161 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKD1P98161 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PKD1P98161 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKD1P98161 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PKD1P98161 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKD1P98161 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKD1P98161 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PKD1P98161 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKD1P98161 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKD1P98161 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKD1P98161 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKD1P98161 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKD1P98161 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKD1P98161 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKD1P98161 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKD1P98161 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKD1P98161 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKD1P98161 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKD1P98161 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKD1P98161 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKD1P98161 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PKD1P98161 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PKD1P98161 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKD1P98161 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKD1P98161 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKD1P98161 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKD1P98161 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PKD1P98161 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PKD1P98161 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKD1P98161 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKD1P98161 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKD1P98161 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKD1P98161 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKD1P98161 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKD1P98161 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKD1P98161 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKD1P98161 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKD1P98161 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKD1P98161 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKD1P98161 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKD1P98161 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKD1P98161 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKD1P98161 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKD1P98161 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKD1P98161 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKD1P98161 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms