Protein–RNA interactions for Protein: P80404

ABAT, 4-aminobutyrate aminotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABATP80404 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ABATP80404 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ABATP80404 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABATP80404 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABATP80404 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABATP80404 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABATP80404 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABATP80404 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABATP80404 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABATP80404 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABATP80404 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ABATP80404 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABATP80404 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABATP80404 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABATP80404 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABATP80404 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABATP80404 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABATP80404 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABATP80404 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABATP80404 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABATP80404 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABATP80404 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABATP80404 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABATP80404 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABATP80404 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABATP80404 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABATP80404 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABATP80404 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABATP80404 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABATP80404 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABATP80404 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABATP80404 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABATP80404 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABATP80404 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABATP80404 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABATP80404 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABATP80404 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABATP80404 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABATP80404 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABATP80404 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABATP80404 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABATP80404 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABATP80404 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABATP80404 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABATP80404 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABATP80404 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABATP80404 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABATP80404 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABATP80404 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABATP80404 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABATP80404 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABATP80404 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABATP80404 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABATP80404 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABATP80404 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABATP80404 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABATP80404 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABATP80404 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABATP80404 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABATP80404 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ABATP80404 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ABATP80404 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABATP80404 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABATP80404 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABATP80404 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABATP80404 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABATP80404 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABATP80404 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABATP80404 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABATP80404 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ABATP80404 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABATP80404 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABATP80404 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABATP80404 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABATP80404 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABATP80404 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABATP80404 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABATP80404 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABATP80404 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABATP80404 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABATP80404 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABATP80404 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABATP80404 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABATP80404 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABATP80404 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ABATP80404 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ABATP80404 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABATP80404 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABATP80404 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABATP80404 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABATP80404 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABATP80404 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABATP80404 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABATP80404 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ABATP80404 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ABATP80404 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABATP80404 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABATP80404 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABATP80404 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ABATP80404 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms