Protein–RNA interactions for Protein: P62987

UBA52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA52P62987 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBA52P62987 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBA52P62987 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBA52P62987 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBA52P62987 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBA52P62987 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBA52P62987 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
UBA52P62987 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBA52P62987 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBA52P62987 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
UBA52P62987 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBA52P62987 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
UBA52P62987 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBA52P62987 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBA52P62987 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBA52P62987 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBA52P62987 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBA52P62987 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBA52P62987 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBA52P62987 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBA52P62987 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBA52P62987 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBA52P62987 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBA52P62987 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBA52P62987 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBA52P62987 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBA52P62987 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBA52P62987 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBA52P62987 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBA52P62987 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBA52P62987 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
UBA52P62987 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBA52P62987 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBA52P62987 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBA52P62987 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBA52P62987 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBA52P62987 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBA52P62987 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBA52P62987 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBA52P62987 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBA52P62987 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBA52P62987 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBA52P62987 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBA52P62987 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBA52P62987 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBA52P62987 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBA52P62987 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBA52P62987 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBA52P62987 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBA52P62987 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBA52P62987 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBA52P62987 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
UBA52P62987 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBA52P62987 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBA52P62987 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBA52P62987 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBA52P62987 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBA52P62987 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBA52P62987 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBA52P62987 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBA52P62987 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBA52P62987 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBA52P62987 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBA52P62987 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBA52P62987 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBA52P62987 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBA52P62987 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBA52P62987 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBA52P62987 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBA52P62987 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBA52P62987 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBA52P62987 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBA52P62987 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBA52P62987 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBA52P62987 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBA52P62987 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBA52P62987 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBA52P62987 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBA52P62987 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBA52P62987 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBA52P62987 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBA52P62987 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBA52P62987 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBA52P62987 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBA52P62987 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBA52P62987 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBA52P62987 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBA52P62987 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBA52P62987 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
UBA52P62987 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
UBA52P62987 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBA52P62987 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBA52P62987 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBA52P62987 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
UBA52P62987 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBA52P62987 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBA52P62987 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBA52P62987 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBA52P62987 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBA52P62987 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms