Protein–RNA interactions for Protein: P62888

RPL30, 60S ribosomal protein L30, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL30P62888 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL30P62888 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL30P62888 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL30P62888 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL30P62888 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL30P62888 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL30P62888 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL30P62888 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL30P62888 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL30P62888 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL30P62888 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL30P62888 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL30P62888 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL30P62888 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL30P62888 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL30P62888 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL30P62888 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL30P62888 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL30P62888 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL30P62888 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL30P62888 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL30P62888 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL30P62888 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL30P62888 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL30P62888 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL30P62888 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL30P62888 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL30P62888 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL30P62888 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL30P62888 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL30P62888 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL30P62888 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL30P62888 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL30P62888 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL30P62888 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL30P62888 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL30P62888 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL30P62888 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL30P62888 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL30P62888 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL30P62888 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL30P62888 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL30P62888 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL30P62888 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL30P62888 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL30P62888 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL30P62888 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL30P62888 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL30P62888 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL30P62888 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL30P62888 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL30P62888 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL30P62888 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL30P62888 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL30P62888 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL30P62888 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL30P62888 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL30P62888 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL30P62888 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL30P62888 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL30P62888 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL30P62888 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL30P62888 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL30P62888 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL30P62888 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL30P62888 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL30P62888 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL30P62888 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL30P62888 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL30P62888 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL30P62888 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL30P62888 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL30P62888 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL30P62888 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL30P62888 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL30P62888 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL30P62888 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL30P62888 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL30P62888 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL30P62888 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL30P62888 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL30P62888 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL30P62888 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL30P62888 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL30P62888 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL30P62888 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL30P62888 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL30P62888 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RPL30P62888 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RPL30P62888 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL30P62888 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL30P62888 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL30P62888 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL30P62888 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL30P62888 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL30P62888 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL30P62888 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL30P62888 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL30P62888 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL30P62888 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms