Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2FP61218 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms