Protein–RNA interactions for Protein: P60606

CTXN1, Cortexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN1P60606 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTXN1P60606 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTXN1P60606 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTXN1P60606 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTXN1P60606 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTXN1P60606 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTXN1P60606 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTXN1P60606 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTXN1P60606 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTXN1P60606 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CTXN1P60606 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CTXN1P60606 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTXN1P60606 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTXN1P60606 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTXN1P60606 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTXN1P60606 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTXN1P60606 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTXN1P60606 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTXN1P60606 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTXN1P60606 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTXN1P60606 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTXN1P60606 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTXN1P60606 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CTXN1P60606 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTXN1P60606 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTXN1P60606 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTXN1P60606 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTXN1P60606 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTXN1P60606 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTXN1P60606 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTXN1P60606 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CTXN1P60606 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTXN1P60606 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTXN1P60606 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTXN1P60606 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTXN1P60606 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTXN1P60606 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTXN1P60606 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTXN1P60606 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTXN1P60606 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTXN1P60606 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTXN1P60606 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTXN1P60606 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTXN1P60606 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTXN1P60606 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTXN1P60606 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTXN1P60606 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTXN1P60606 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CTXN1P60606 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTXN1P60606 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTXN1P60606 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTXN1P60606 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTXN1P60606 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTXN1P60606 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTXN1P60606 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTXN1P60606 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTXN1P60606 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTXN1P60606 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTXN1P60606 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTXN1P60606 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTXN1P60606 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTXN1P60606 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTXN1P60606 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTXN1P60606 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTXN1P60606 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTXN1P60606 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTXN1P60606 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTXN1P60606 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTXN1P60606 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTXN1P60606 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms