Protein–RNA interactions for Protein: P55809

OXCT1, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXCT1P55809 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OXCT1P55809 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OXCT1P55809 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
OXCT1P55809 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
OXCT1P55809 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OXCT1P55809 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OXCT1P55809 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OXCT1P55809 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OXCT1P55809 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OXCT1P55809 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OXCT1P55809 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OXCT1P55809 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OXCT1P55809 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OXCT1P55809 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
OXCT1P55809 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
OXCT1P55809 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OXCT1P55809 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OXCT1P55809 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
OXCT1P55809 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OXCT1P55809 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
OXCT1P55809 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OXCT1P55809 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
OXCT1P55809 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OXCT1P55809 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
OXCT1P55809 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OXCT1P55809 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OXCT1P55809 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OXCT1P55809 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OXCT1P55809 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
OXCT1P55809 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
OXCT1P55809 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
OXCT1P55809 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
OXCT1P55809 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
OXCT1P55809 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OXCT1P55809 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OXCT1P55809 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
OXCT1P55809 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
OXCT1P55809 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OXCT1P55809 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
OXCT1P55809 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
OXCT1P55809 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
OXCT1P55809 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
OXCT1P55809 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
OXCT1P55809 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OXCT1P55809 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OXCT1P55809 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
OXCT1P55809 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
OXCT1P55809 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
OXCT1P55809 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
OXCT1P55809 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
OXCT1P55809 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
OXCT1P55809 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
OXCT1P55809 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
OXCT1P55809 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
OXCT1P55809 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
OXCT1P55809 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
OXCT1P55809 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
OXCT1P55809 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
OXCT1P55809 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
OXCT1P55809 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
OXCT1P55809 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OXCT1P55809 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OXCT1P55809 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OXCT1P55809 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OXCT1P55809 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OXCT1P55809 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OXCT1P55809 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
OXCT1P55809 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OXCT1P55809 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OXCT1P55809 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OXCT1P55809 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OXCT1P55809 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
OXCT1P55809 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OXCT1P55809 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
OXCT1P55809 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
OXCT1P55809 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
OXCT1P55809 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
OXCT1P55809 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
OXCT1P55809 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
OXCT1P55809 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
OXCT1P55809 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OXCT1P55809 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OXCT1P55809 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OXCT1P55809 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OXCT1P55809 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OXCT1P55809 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OXCT1P55809 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
OXCT1P55809 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OXCT1P55809 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OXCT1P55809 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OXCT1P55809 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OXCT1P55809 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OXCT1P55809 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
OXCT1P55809 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OXCT1P55809 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
OXCT1P55809 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OXCT1P55809 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
OXCT1P55809 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
OXCT1P55809 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
OXCT1P55809 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms