Protein–RNA interactions for Protein: P55273

CDKN2D, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2DP55273 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKN2DP55273 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKN2DP55273 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKN2DP55273 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKN2DP55273 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKN2DP55273 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKN2DP55273 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKN2DP55273 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKN2DP55273 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKN2DP55273 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKN2DP55273 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDKN2DP55273 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDKN2DP55273 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDKN2DP55273 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDKN2DP55273 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN2DP55273 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN2DP55273 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN2DP55273 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN2DP55273 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN2DP55273 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN2DP55273 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN2DP55273 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN2DP55273 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN2DP55273 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN2DP55273 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN2DP55273 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN2DP55273 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN2DP55273 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN2DP55273 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN2DP55273 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN2DP55273 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN2DP55273 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN2DP55273 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN2DP55273 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN2DP55273 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN2DP55273 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN2DP55273 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN2DP55273 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN2DP55273 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN2DP55273 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN2DP55273 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN2DP55273 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN2DP55273 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKN2DP55273 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKN2DP55273 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKN2DP55273 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKN2DP55273 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKN2DP55273 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKN2DP55273 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKN2DP55273 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKN2DP55273 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN2DP55273 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN2DP55273 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN2DP55273 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN2DP55273 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN2DP55273 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN2DP55273 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN2DP55273 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN2DP55273 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN2DP55273 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN2DP55273 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN2DP55273 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN2DP55273 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN2DP55273 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2DP55273 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2DP55273 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2DP55273 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2DP55273 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2DP55273 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2DP55273 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2DP55273 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2DP55273 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2DP55273 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2DP55273 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2DP55273 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2DP55273 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKN2DP55273 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKN2DP55273 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKN2DP55273 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKN2DP55273 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKN2DP55273 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKN2DP55273 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKN2DP55273 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKN2DP55273 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDKN2DP55273 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDKN2DP55273 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDKN2DP55273 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKN2DP55273 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKN2DP55273 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKN2DP55273 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKN2DP55273 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKN2DP55273 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKN2DP55273 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKN2DP55273 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKN2DP55273 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKN2DP55273 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKN2DP55273 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKN2DP55273 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKN2DP55273 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CDKN2DP55273 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms