Protein–RNA interactions for Protein: P51668

UBE2D1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D1P51668 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2D1P51668 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2D1P51668 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms