Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PDE6CP51160 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE6CP51160 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE6CP51160 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE6CP51160 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE6CP51160 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE6CP51160 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE6CP51160 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE6CP51160 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE6CP51160 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE6CP51160 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE6CP51160 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE6CP51160 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE6CP51160 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE6CP51160 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE6CP51160 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE6CP51160 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE6CP51160 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE6CP51160 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE6CP51160 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE6CP51160 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE6CP51160 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE6CP51160 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE6CP51160 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE6CP51160 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE6CP51160 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE6CP51160 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE6CP51160 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE6CP51160 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE6CP51160 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE6CP51160 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE6CP51160 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE6CP51160 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE6CP51160 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE6CP51160 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE6CP51160 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE6CP51160 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE6CP51160 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE6CP51160 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE6CP51160 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE6CP51160 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE6CP51160 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE6CP51160 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE6CP51160 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE6CP51160 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE6CP51160 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE6CP51160 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE6CP51160 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE6CP51160 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE6CP51160 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE6CP51160 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE6CP51160 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE6CP51160 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE6CP51160 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE6CP51160 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE6CP51160 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE6CP51160 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE6CP51160 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE6CP51160 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE6CP51160 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE6CP51160 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE6CP51160 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE6CP51160 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE6CP51160 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE6CP51160 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE6CP51160 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE6CP51160 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE6CP51160 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE6CP51160 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE6CP51160 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PDE6CP51160 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PDE6CP51160 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE6CP51160 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PDE6CP51160 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE6CP51160 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE6CP51160 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PDE6CP51160 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE6CP51160 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE6CP51160 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE6CP51160 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE6CP51160 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE6CP51160 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE6CP51160 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE6CP51160 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE6CP51160 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE6CP51160 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE6CP51160 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE6CP51160 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE6CP51160 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE6CP51160 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE6CP51160 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE6CP51160 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE6CP51160 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE6CP51160 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE6CP51160 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE6CP51160 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE6CP51160 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE6CP51160 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE6CP51160 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE6CP51160 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms