Protein–RNA interactions for Protein: P49721

PSMB2, Proteasome subunit beta type-2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB2P49721 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms