Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RPIAP49247 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPIAP49247 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPIAP49247 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPIAP49247 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPIAP49247 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPIAP49247 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPIAP49247 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPIAP49247 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPIAP49247 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPIAP49247 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPIAP49247 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPIAP49247 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPIAP49247 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPIAP49247 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPIAP49247 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPIAP49247 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPIAP49247 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPIAP49247 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPIAP49247 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPIAP49247 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPIAP49247 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPIAP49247 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPIAP49247 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPIAP49247 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPIAP49247 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPIAP49247 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPIAP49247 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPIAP49247 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPIAP49247 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPIAP49247 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPIAP49247 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPIAP49247 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPIAP49247 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPIAP49247 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPIAP49247 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
RPIAP49247 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPIAP49247 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPIAP49247 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPIAP49247 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPIAP49247 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPIAP49247 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPIAP49247 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPIAP49247 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPIAP49247 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RPIAP49247 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RPIAP49247 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPIAP49247 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPIAP49247 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RPIAP49247 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPIAP49247 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RPIAP49247 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPIAP49247 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPIAP49247 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPIAP49247 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPIAP49247 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPIAP49247 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPIAP49247 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPIAP49247 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPIAP49247 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPIAP49247 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPIAP49247 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPIAP49247 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPIAP49247 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPIAP49247 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPIAP49247 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPIAP49247 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPIAP49247 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPIAP49247 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPIAP49247 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPIAP49247 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RPIAP49247 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPIAP49247 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPIAP49247 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPIAP49247 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPIAP49247 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPIAP49247 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPIAP49247 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPIAP49247 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPIAP49247 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPIAP49247 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPIAP49247 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPIAP49247 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPIAP49247 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RPIAP49247 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPIAP49247 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPIAP49247 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPIAP49247 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPIAP49247 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPIAP49247 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPIAP49247 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPIAP49247 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RPIAP49247 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPIAP49247 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPIAP49247 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPIAP49247 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPIAP49247 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPIAP49247 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPIAP49247 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPIAP49247 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms