Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PTDSS1P48651 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTDSS1P48651 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTDSS1P48651 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTDSS1P48651 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTDSS1P48651 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTDSS1P48651 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTDSS1P48651 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTDSS1P48651 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTDSS1P48651 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTDSS1P48651 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTDSS1P48651 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTDSS1P48651 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTDSS1P48651 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTDSS1P48651 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTDSS1P48651 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTDSS1P48651 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTDSS1P48651 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTDSS1P48651 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTDSS1P48651 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTDSS1P48651 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTDSS1P48651 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTDSS1P48651 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTDSS1P48651 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTDSS1P48651 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTDSS1P48651 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTDSS1P48651 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTDSS1P48651 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTDSS1P48651 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTDSS1P48651 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTDSS1P48651 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTDSS1P48651 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTDSS1P48651 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTDSS1P48651 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTDSS1P48651 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTDSS1P48651 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTDSS1P48651 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTDSS1P48651 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTDSS1P48651 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTDSS1P48651 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTDSS1P48651 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTDSS1P48651 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTDSS1P48651 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTDSS1P48651 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTDSS1P48651 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTDSS1P48651 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTDSS1P48651 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTDSS1P48651 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTDSS1P48651 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTDSS1P48651 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTDSS1P48651 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTDSS1P48651 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTDSS1P48651 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTDSS1P48651 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTDSS1P48651 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTDSS1P48651 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTDSS1P48651 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTDSS1P48651 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTDSS1P48651 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTDSS1P48651 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTDSS1P48651 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTDSS1P48651 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTDSS1P48651 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTDSS1P48651 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTDSS1P48651 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTDSS1P48651 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTDSS1P48651 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PTDSS1P48651 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTDSS1P48651 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTDSS1P48651 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTDSS1P48651 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms