Protein–RNA interactions for Protein: P48443

RXRG, Retinoic acid receptor RXR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRGP48443 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RXRGP48443 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RXRGP48443 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RXRGP48443 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RXRGP48443 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RXRGP48443 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RXRGP48443 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RXRGP48443 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RXRGP48443 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RXRGP48443 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RXRGP48443 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RXRGP48443 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RXRGP48443 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RXRGP48443 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RXRGP48443 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RXRGP48443 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RXRGP48443 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RXRGP48443 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RXRGP48443 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RXRGP48443 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RXRGP48443 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RXRGP48443 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RXRGP48443 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RXRGP48443 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RXRGP48443 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RXRGP48443 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RXRGP48443 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RXRGP48443 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RXRGP48443 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RXRGP48443 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RXRGP48443 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RXRGP48443 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RXRGP48443 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RXRGP48443 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RXRGP48443 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RXRGP48443 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RXRGP48443 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RXRGP48443 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RXRGP48443 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RXRGP48443 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RXRGP48443 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RXRGP48443 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RXRGP48443 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RXRGP48443 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RXRGP48443 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RXRGP48443 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RXRGP48443 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RXRGP48443 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RXRGP48443 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RXRGP48443 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RXRGP48443 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RXRGP48443 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RXRGP48443 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RXRGP48443 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RXRGP48443 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RXRGP48443 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RXRGP48443 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RXRGP48443 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RXRGP48443 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RXRGP48443 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RXRGP48443 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RXRGP48443 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RXRGP48443 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RXRGP48443 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RXRGP48443 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RXRGP48443 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RXRGP48443 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RXRGP48443 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RXRGP48443 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RXRGP48443 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RXRGP48443 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RXRGP48443 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RXRGP48443 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RXRGP48443 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RXRGP48443 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RXRGP48443 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RXRGP48443 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RXRGP48443 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RXRGP48443 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RXRGP48443 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RXRGP48443 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RXRGP48443 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RXRGP48443 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RXRGP48443 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RXRGP48443 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RXRGP48443 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RXRGP48443 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RXRGP48443 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RXRGP48443 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RXRGP48443 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RXRGP48443 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RXRGP48443 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RXRGP48443 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RXRGP48443 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RXRGP48443 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RXRGP48443 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RXRGP48443 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RXRGP48443 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RXRGP48443 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RXRGP48443 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms