Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ME1P48163 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ME1P48163 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ME1P48163 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ME1P48163 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ME1P48163 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ME1P48163 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ME1P48163 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ME1P48163 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ME1P48163 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ME1P48163 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ME1P48163 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ME1P48163 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ME1P48163 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ME1P48163 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ME1P48163 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ME1P48163 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ME1P48163 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ME1P48163 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ME1P48163 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ME1P48163 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ME1P48163 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ME1P48163 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ME1P48163 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ME1P48163 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ME1P48163 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ME1P48163 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ME1P48163 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ME1P48163 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ME1P48163 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ME1P48163 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ME1P48163 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ME1P48163 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ME1P48163 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ME1P48163 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ME1P48163 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ME1P48163 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ME1P48163 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ME1P48163 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ME1P48163 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ME1P48163 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ME1P48163 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ME1P48163 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ME1P48163 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ME1P48163 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ME1P48163 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ME1P48163 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ME1P48163 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ME1P48163 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ME1P48163 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ME1P48163 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ME1P48163 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ME1P48163 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ME1P48163 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ME1P48163 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ME1P48163 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ME1P48163 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ME1P48163 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ME1P48163 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ME1P48163 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ME1P48163 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ME1P48163 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ME1P48163 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ME1P48163 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ME1P48163 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ME1P48163 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ME1P48163 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ME1P48163 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ME1P48163 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ME1P48163 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ME1P48163 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ME1P48163 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ME1P48163 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ME1P48163 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ME1P48163 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ME1P48163 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ME1P48163 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ME1P48163 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ME1P48163 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ME1P48163 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ME1P48163 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ME1P48163 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ME1P48163 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ME1P48163 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ME1P48163 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ME1P48163 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ME1P48163 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ME1P48163 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ME1P48163 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ME1P48163 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ME1P48163 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ME1P48163 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ME1P48163 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ME1P48163 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ME1P48163 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ME1P48163 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ME1P48163 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ME1P48163 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ME1P48163 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ME1P48163 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms