Protein–RNA interactions for Protein: P47710

CSN1S1, Alpha-S1-casein, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN1S1P47710 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CSN1S1P47710 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSN1S1P47710 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms