Protein–RNA interactions for Protein: P47224

RABIF, Guanine nucleotide exchange factor MSS4, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABIFP47224 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RABIFP47224 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RABIFP47224 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RABIFP47224 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RABIFP47224 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RABIFP47224 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RABIFP47224 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RABIFP47224 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RABIFP47224 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RABIFP47224 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RABIFP47224 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RABIFP47224 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RABIFP47224 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RABIFP47224 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RABIFP47224 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RABIFP47224 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RABIFP47224 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RABIFP47224 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RABIFP47224 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RABIFP47224 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RABIFP47224 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RABIFP47224 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RABIFP47224 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RABIFP47224 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RABIFP47224 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RABIFP47224 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RABIFP47224 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RABIFP47224 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RABIFP47224 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RABIFP47224 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RABIFP47224 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RABIFP47224 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RABIFP47224 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RABIFP47224 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RABIFP47224 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RABIFP47224 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RABIFP47224 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RABIFP47224 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RABIFP47224 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RABIFP47224 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RABIFP47224 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RABIFP47224 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RABIFP47224 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RABIFP47224 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RABIFP47224 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RABIFP47224 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RABIFP47224 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RABIFP47224 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RABIFP47224 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RABIFP47224 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RABIFP47224 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RABIFP47224 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RABIFP47224 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RABIFP47224 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RABIFP47224 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RABIFP47224 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RABIFP47224 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RABIFP47224 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RABIFP47224 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RABIFP47224 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RABIFP47224 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RABIFP47224 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RABIFP47224 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RABIFP47224 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RABIFP47224 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RABIFP47224 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RABIFP47224 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RABIFP47224 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RABIFP47224 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RABIFP47224 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RABIFP47224 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RABIFP47224 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RABIFP47224 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RABIFP47224 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RABIFP47224 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RABIFP47224 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RABIFP47224 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RABIFP47224 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RABIFP47224 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RABIFP47224 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RABIFP47224 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RABIFP47224 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RABIFP47224 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RABIFP47224 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RABIFP47224 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RABIFP47224 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RABIFP47224 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RABIFP47224 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RABIFP47224 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RABIFP47224 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RABIFP47224 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RABIFP47224 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RABIFP47224 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RABIFP47224 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RABIFP47224 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RABIFP47224 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RABIFP47224 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RABIFP47224 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RABIFP47224 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RABIFP47224 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms