Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GNPDA1P46926 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GNPDA1P46926 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GNPDA1P46926 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GNPDA1P46926 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GNPDA1P46926 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GNPDA1P46926 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GNPDA1P46926 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GNPDA1P46926 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GNPDA1P46926 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GNPDA1P46926 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GNPDA1P46926 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GNPDA1P46926 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms