Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRCC3P46736 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRCC3P46736 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRCC3P46736 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
BRCC3P46736 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRCC3P46736 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRCC3P46736 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRCC3P46736 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRCC3P46736 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRCC3P46736 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRCC3P46736 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRCC3P46736 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRCC3P46736 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRCC3P46736 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRCC3P46736 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRCC3P46736 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRCC3P46736 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRCC3P46736 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRCC3P46736 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRCC3P46736 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRCC3P46736 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRCC3P46736 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRCC3P46736 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRCC3P46736 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRCC3P46736 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
BRCC3P46736 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRCC3P46736 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRCC3P46736 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRCC3P46736 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRCC3P46736 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRCC3P46736 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRCC3P46736 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRCC3P46736 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRCC3P46736 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRCC3P46736 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRCC3P46736 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRCC3P46736 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRCC3P46736 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRCC3P46736 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRCC3P46736 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
BRCC3P46736 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRCC3P46736 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRCC3P46736 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRCC3P46736 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRCC3P46736 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRCC3P46736 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRCC3P46736 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRCC3P46736 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRCC3P46736 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRCC3P46736 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRCC3P46736 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRCC3P46736 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRCC3P46736 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRCC3P46736 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRCC3P46736 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRCC3P46736 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRCC3P46736 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
BRCC3P46736 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
BRCC3P46736 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRCC3P46736 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRCC3P46736 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRCC3P46736 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRCC3P46736 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRCC3P46736 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRCC3P46736 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRCC3P46736 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRCC3P46736 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRCC3P46736 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRCC3P46736 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRCC3P46736 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRCC3P46736 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRCC3P46736 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRCC3P46736 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRCC3P46736 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRCC3P46736 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRCC3P46736 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
BRCC3P46736 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRCC3P46736 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRCC3P46736 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRCC3P46736 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRCC3P46736 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRCC3P46736 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRCC3P46736 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRCC3P46736 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
BRCC3P46736 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
BRCC3P46736 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRCC3P46736 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRCC3P46736 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRCC3P46736 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
BRCC3P46736 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
BRCC3P46736 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRCC3P46736 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRCC3P46736 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRCC3P46736 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRCC3P46736 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRCC3P46736 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRCC3P46736 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRCC3P46736 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRCC3P46736 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms